เมื่อปี พ.ศ. 2538 เมอร์คได้สร้างศูนย์กระจายเคมีภัณฑ์บนพื้นที่ 4,800 ตารางเมตร ณ นิคมอุตสาหกรรมบางปู เพื่อเป็นคลังเก็บสินค้าเคมีภัณฑ์ ให้เพียงพอกับความต้องการภายในประเทศ นอกจากจะปฏิบัติตามกฎความปลอดภัย และสิ่งแวดล้อมของไทยแล้ว เมอร์คยังได้นำนโยบาย HSE ของกลุ่ม บริษัท เมอร์ค ทั่วโลกมาปฏิบัติ ณ ศูนย์กระจายเคมีภัณฑ์แห่งนี้ด้วย หลักสำคัญของนโยบายนี้ประกอบด้วย อาชีวอนามัย (Health), ความปลอดภัย (Safety) และสิ่งแวดล้อม (Environment) เนื่องจากความต้องการเคมีภัณฑ์ภายในประเทศไทยเพิ่มมากขึ้นเรื่อยๆ เมอร์คจึงตัดสินใจลงทุนอีก 75 ล้านบาทในปี 2543 เพื่อขยายคลังสินค้าพื้นที่ที่เพิ่มขึ้นเป็นมากกว่า 2 เท่า ทำให้สามารถเก็บสินค้าได้กว่า 6,000 ชนิด
เมอร์คยังได้อุทิศเงินเกือบร้อยละ 20 ของเงินลงทุนดังกล่าวให้กับการติดตั้งระบบดับเพลิง และระบบที่ทันสมัยในการจัดเก็บสินค้าอีกด้วย ศูนย์จำหน่ายเคมีภัณฑ์แห่งนี้ จะช่วยให้คุณภาพในการบริการลูกค้าของเมอร์คไม่เป็นรองใคร และยังแสดงถึงความห่วงใย ที่เมอร์คมีต่อสังคมและสิ่งแวดล้อมด้วย ศูนย์กระจายเคมีภัณฑ์ของเมอร์คได้ชื่อว่าปลอดภัย และทันสมัยที่สุดในประเทศไทย แผนผังของอาคารได้รับการออกแบบจากผู้เชี่ยวชาญจากเมอร์คที่ประเทศเยอรมนี โดยเคมีภัณฑ์จะถูกเก็บไว้ในส่วนต่างๆ 14 ส่วน ตามมาตรฐานของไทยและเยอรมนี
นอกเหนือไปจากความสามารถในการเก็บสินค้าได้มากขึ้นแล้ว ศูนย์แห่งนี้ยังช่วยให้เมอร์คสามารถรักษาคุณภาพของผลิตภัณฑ์อีกด้วย เนื่องจากมีห้องควบคุมอุณหภูมิเพิ่มขึ้นอีก 2 ห้อง คือ ที่ 15 และ 22 องศาเซลเซียส เพื่อเก็บผลิตภัณฑ์ที่ต้องเก็บไว้ในที่ที่มีอุณหภูมิต่ำ ที่สำคัญยังมีการออกแบบระบบดับเพลิง และป้องกันอัคคีภัยที่ทันสมัยสำหรับศูนย์นี้ โดยเฉพาะอีกด้วย รวมทั้งเครื่องมือการขนย้ายสินค้าที่มีความทันสมัย และปลอดภัยมากที่สุดโดย รถขนย้ายสินค้าพิเศษที่สามารถกันการระเบิดได้ ซึ่งเป็นคันแรกในประเทศไทย
นอกจากนี้ยังมีห้องฝึกอบรม ห้องสาธิตการทดลองที่สามารถรองรับแขกที่มาเยี่ยมชมกิจการ เจ้าหน้าที่จากหน่วยงานราชการและคณะนักศึกษาจากมหาวิทยาลัยได้ถึงครั้งละ 50 คน จุดประสงค์ในการขยายศูนย์กระจายเคมีภัณฑ์ในครั้งนี้ ก็เพื่อให้เมอร์ค สามารถมอบบริการที่ดีที่สุด ดังที่ระบุไว้ในวิสัยทัศน์ของ บริษัท เมอร์ค จำกัด ว่า "บริษัทยาและเคมีภัณฑ์ที่เป็นหนึ่งในใจลูกค้า ในการสร้างสรรค์การบริการที่เป็นเลิศ" นั่นเอง